كریم باقری در گفت‌وگویی با خبرگزاری فوتبال ایران هرگونه اختلاف با علی دایی را رد می‌كند و می‌گوید: «به دلیل برخی از مسائل شخصی نمی‌توانستم برای تورنمنت عمان در خدمت تیم‌ملی باشم به همین دلیل مستقیما با خود شخص علی دایی صحبت كردم و از ایشان اجازه گرفتم. بر سر این موضوع هم هیچ مشكلی به وجود نیامد هرچند كه برخی‌ها دوست دارند دائما برای من و دایی حاشیه درست كنند اما من به این حاشیه‌ها توجه نمی‌كنم.»
وی در ادامه در رابطه با بازی با پاس همدان گفت: «تیم ما در نیمه‌اول خیلی خوب نبود اما در نیمه‌دوم بازیكنان ما عالی كار كردند و جدا از 3 گلی كه زدند چند فرصت گل مسلم را نیز از دست دادند وگرنه با اختلافی بیشتر از سه گل حریف را شكست می‌دادیم.»
باقری در خاتمه در خصوص شانس قهرمانی پرسپولیس خاطرنشان ساخت: «فكر می‌كنم هنوز زود است كه بخواهیم از قهرمانی تیم خاصی حرف بزنیم ضمن آنكه اختلاف 4 امتیازی ما با استقلال اختلاف زیادی نیست كه ما را نسبت به قهرمانی ناامید كرده باشد.ما از قهرمانی لیگ ناامید نیستیم
